Před začátkem sezóny jsem opět koupil pár hráčů:
Spadavecchia | GK | Itálie | z Valencia | 2 400 000 € |
Lagrottaglie | CD | Itálie | z Crotone | 0 € |
Fiore | AM | Itálie | z Florence | 0 € |
Agali | ST | Nigérie | z Marseille | 1 900 000 € |
Tak jako minulou sezónu i letos jsem nebyl nalosovaný přímo do ligy mistrů a tak jsem musel o ní bojovat ve 3. předkole LM. V něm jsem se utkal s Řeckým Olympiakosem Pireus. Dvojzápas jsem začal na domácí půdě, ale zápas se mi moc nepovedl a Řekové si tak vezli do domácí odvety slibnou remízu 1-1. V Řecku se mi zápas povedl o dost lépe a i když v závěru Pireus snížil, tak já vyhrál 3-2 a postoupil do základní skupiny Ligy mistrů. V ní jsem dostal AC Milán, Celtic Glasgow a Atlétiko Bilbao. Po dvou vítězných zápasem to vypadalo velmi dobřem, ale poté jsem ze čtyř zápasů získal jen 1 bod a nakonec skončil čtvrtý. V lize jsem za podzimních 16 kol jenom jednou remizoval v Teplicích 2:2, jinak sem vše vyhrál, ale i tak se mnou Sparta držela kontakt.
V zimní přestávce jsem prodal obránce Jura Poborského do Utrechtu za zhruba 500 000tisíc euro a půjčil dalšího obránce Martina Brozobohatého do Brna, kterého později odemně koupili za 1,4 milionu eur. Koupil jsem akorát brazilského stopera Carlinhose z Lutychu, který mě stál 1,2 milionů eur.
Na jaře jsem dále bojoval o víteství se Spartou, ale nakonec i díky tomu že jsem porazil i ve druhém vzájemném střetnutí Letenské jsem nakonec ligu vyhrál o 19 bodů. V poháru jsem ve finále narazil na Jablonec, který jsem porazil 3:0 a vyhrál tak i domácí pohár.
Na konci sezóny jsem se musel rozloučit s třemi hráči, kteří ukončili kariéru. Byl to stoper Ivan Cordoba a útočníci Desiré Mbonabucya a Vladimír Šmicer.